死神武器职业专门学校，简称“死武专”。其学生分为“工匠”与“武器”。　　据称，收集99个鬼神的灵魂与1个魔女的灵魂，“武器”就会进化成最强的死神武器“DEATH SCYTHE”　　以最强的“工匠”为目标的镰刀“工匠”玛嘉与其“武器”SOUL二人，开始了艰辛的试炼。有同样目标的还有暗器“工匠”BLACK STAR与“武器”务椿，和死神之子——死神•德•基德与他的武器双枪姐妹。　　三组少男少女成长的故事，伴随着的是“死武专”的危机四伏。神秘的魔女美杜莎心怀鬼胎；死神大人不离开“死武专”寸步，似乎也是为了隐藏天大的秘密。

十年前，东京出现了一个不能解释的领域。从那片领域走出的人获得了一种特殊的超能力——可以随意夺取他们的性命。却如恶魔般从此失去了梦与心。那片神秘的区域被叫做地狱门，而那些因此获取超能力的人被叫做契约者。美国的CIA，英国的MI6，日本的警视厅统统对神秘的地狱门进行了调查研究，甚至那个庞大的神秘组织潘多拉也开展行动，妄图消灭契约者们。知道真相的契约者们则团结在一起进行对抗。而另一方面，有着“黑之死神”之名的黑（木内秀信 配音）接受命令执行着组织的任务，同时也一直在寻找5年前失踪的妹妹。在执行任务的过程中黑偶遇之前的恋人琥珀（川上伦子 配音），发现眼前此人似乎隐藏着一些不为人知的秘密。究竟黑会不会知道琥珀真正的身份？他和妹妹是否能重逢？而人类和契约者的情况会如何发展？

　　初中生小野泽未来（花村怜美 配音）是一个叛逆的少女，虽然有着幸福的家庭和可爱的弟弟小野泽悠贵（小林由美子 配音），但日复一日的平静生活让未来觉得十分厌倦。这一天，一切都改变了，东京发生了震度为8.0级的超级大地震，未来所熟悉的街道和设施在煞那间全部崩坏了，周围充斥着哭喊和哀嚎的人们。为了和失散的父母团聚，未来和悠贵决定朝着家的方向前进。　　在路上，姐弟两遇见了成熟稳重的摩托车骑手日下部真理（泷川雅美 配音），三人决定一同行动。在经历了火灾、余震、疾病等危机的同时，未来逐渐明白了家人和爱的意义。家就在前方，未来和悠贵，他们能够顺利完成这段危险的路程吗？

　　抗日战争时期，华北某地。我八路军的一座兵工厂突然发生爆炸，保卫部周部长（浦克 饰）断定是敌人所为，急令侦察科王科长（庞学勤 饰）立即侦办，同时派部队搜索追踪。王科长在搜索途中，发现在一座古庙附近有一具尸体和两把刀，周部长认为古庙里大有文章，他安排王科长以养病为由带虎子（李希达 饰）进庙侦察，奇怪的是庙里只有一老一小俩和尚。小和尚（陈克然 饰）原本不是哑巴，五年前，庙里香火正旺，突然冲进来一伙匪徒把正在念经的众和尚全杀了，幸存下来的小和尚被害成哑巴。通过日夜侦察，王科长发现这里潜伏着一个极其危险的地下特务组织，他们直接受日本特务机关领导，而且正策划下一步破坏活动。紧急时刻，王科长以检查身体为由，准备回去向上级报告。老和尚（田烈 饰）暗窃，准备在途中对王科长下手，可是他高兴得太早了......

　　五十年代的北方某地，境外间谍机关委派女特务李文英（白玫 饰）潜入我东北地区，企图组织敌特空投。此时正值全国镇反运动期间，李的行动处处碰壁。正在此时，我侦察员冯广发（王心刚 饰）假借生意亏本而结识了李文英，经过几次试探和考验，冯取得李的信任。李委派他去香港和上司孙威廉（浦克 饰）接头，老奸巨猾的孙对冯仍心存疑虑，布下各种刁难考验冯，冯心地坦然且不露破绽，终蠃孙的信任。美国间谍皮斯利（车轩 饰）却仍对冯的真实身份有怀疑，他用美国所谓的“心理测谎器”对冯进行强大的心理攻势，冯最终经受住了考验。疑心未消的敌人在几天后的一个夜晚，假借送其潜回大陆，在船上演出了一套“苦肉计”，又被冯识破。从此，敌人黔驴技穷，彻底相信了冯广发，并委以重任......

　　抗日战争时期，东北长白山地区。汉族小伙刘金保（赵联 饰）和朝鲜族青年金永俊（白英宽 饰）结伴去深山挖参，以此维持两家各自的贫困生活。不料遭遇巡山的日寇讨伐队，为保护金保，永俊受伤落下山崖。金保以为永俊已死，绝望回家，他把卖参所得交给永俊父母，誓言今后做一个儿子义务。劳作中，他与永俊妹妹惠淑产生感情，汉奸小棒子（李亚林 饰）设计诈取了金保他们的血汗钱，并欲欺侮永俊的未婚妻，金保将其救下，小棒子枉按罪名抓走金保。大难不死被抗联救起的永俊回家了，作证救出金保，阴险的小棒子以私通游击队为名将他逮捕，金保在深里将永俊救出，永俊怀着复仇的渴望......