丝碧卡・瓦戈的目标是考上「戴安娜魔术学校」，成为一等魔术师。但却一直无法成功使用魔法飞行。某一天她遇到了一只会讲人话的黑猫，没想到那只黑猫的真实身份竟然是失踪的魔术大师克劳德！克劳德为了解开诅咒，必须要借用丝碧卡的魔力。然而目前丝碧卡的魔力还远远不够，因此克劳德便开始教导丝碧卡练习魔法、增强实力，让她朝着成为一等魔术师的目标前进！

15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。

年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲，不惜触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了肉体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪，找回失去的一切，兄弟二人踏上了寻找传说中的“贤者之石”的旅程。几年后，一位右臂与左腿都是由“机械铠甲”替代的国家炼金术士出现在人们的眼前，他被称作“钢之炼金术师”。 

带着容易引起灾难的危险秘宝“魔剑目录”，居无定所的流浪剑士，殇不患。从祖国西幽离开辗转来到了东离之地后，好不容易获得了一时安宁的他，不料被仇敌“祸世螟蝗”得知这个消息，再次陷入危机之中。从遥远的西幽不断接揰而来的异能、异形的刺客们。就在殇不患面对这样的困境之中，身穿红莲之衣谜一般的吟游诗人就此现身。

在一次邂逅中得到死神的力量而成为“代理死神”的黑崎一护，被卷入死在现世的魂魄所聚集的地方——尸魂界的动乱中，在激烈的战斗中 和同伴一起也成长了很多。因为一护的生活，所生活的空座町发生了异变。新的死神和新的敌人的出现，以及呼救声。一护再次拿起斩魄刀，踏上战场。另一方面，在尸魂界观测到现世中的虚突然连续消失 被引导到这片土地的灵魂所生活的流魂街居民们发生了失踪 并且死神们驻守的灵屋・瀞灵廷被贼军袭击。贼军的真实身份是灭却师始祖・友哈巴赫所率领的“无形帝国”。“无形帝国”向死神们宣战。5天后，尸魂界被“无形帝国”歼灭 历经千年之久死神们所背负的因缘。那个宿命和隐藏的真相终于被揭开。一切都走向终结。黑崎一护，最后的战斗开始了——

“维斯顿井”是位于海洋与陆地之间的一个异世界。那是一个深海与天空共存的世界，以地热和人的“灵气之力”为源头，甚至妖精费拉里奥与黑暗混沌共存。 A国的地方领主德雷克·拉夫特为了增强军事实力，试图吸引拥有强大气场的地表人类。其中一人，翔扎马，被授予灵气战士丹拜因，并被视为圣战士。然而，当他遇见叛逆者尼伊·吉文和他的追随者，地球女孩玛维尔·弗罗兹时，他面对了一些令人费解的话语。 “一个什么都不知道却帮助德雷克的愚蠢男人。”最终，“维斯顿之井”的冲突发展成为一团巨大的战争阴云，并席卷了地面世界。

五角世界是一个由五颗行星围绕双太阳（太阳）组成的太阳系。在科姆星球的郊外，住着两个年轻人，达巴麦洛德和米拉乌曹，他们怀揣着远大的志向，离开家乡。五角世界虽然由统治者波塞冬统治，但政治腐败，各地叛军兴起，战乱不断。当达巴和他的朋友们遇到前强盗法内里亚·阿姆 (Fanneria Am) 和同样雄心勃勃的加布里特·加布雷 (Gabret Gabrai) 并发生冲突时，他们了解了五角大楼世界的真正本质。达巴驾驶着重金属L-Gaim与波塞冬军作战，最终成为叛军的领袖。

西元1999年，一顆不明的巨大「流星」墜落在地球上。之後調查證實這其實是一艘外星人的宇宙船，之後世界的某些強國為了將其修復並彌補墜落時對地球環境所造成的破壞（還得掩蓋掉這個外星船墜落的事實），而組成了統合政府。並由地球統合軍將其改造成為全長1200公尺的超大型主力戰艦，命名為「馬克羅斯」（MACROSS，德文「大宇宙」之意）。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂，在綿延的爭戰中馬克羅斯的改修則仍然持續著。直到10年後，在馬克羅斯舉行正式起用下水典禮的當天，在月球軌道附近突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅斯艦上的主炮竟自動發射，並擊中在月球出現的外星艦隊觀測艦！事已至如此頓時成了趕鴨子上架，不把對方惹毛才是怪事……於是統合軍只好展開接戰，並讓馬克羅斯升空啟航，以轉移敵方注意。青年一條輝陰錯陽差的坐上了統合軍的戰機捲入戰鬥，並救起了一位名叫林明美的少女，且與艦上女軍官早賴未沙的不吵不相識……被稱為「第一次宇宙大戰」的這場人類對異星人的戰爭就此揭開了序幕。而圍繞在輝、明美與未沙之間的感情糾葛，卻也開始介入了戰事的發展之中，甚而成為主導後來歷史走向的契機……

遥远未来，世界人口数在迎来巅峰后，开始呈现下降的趋势。人类为了让物种繁荣存续，制作出管理生态系的AI，并执行「人类多样化实验」。常人、兽人、魔族等经过遗传因子改造诞生的「多样人种」，在环绕高壁的生活圈之中，打造出被称作「CLUSTA」的「多样城镇」。有着丰富人口的「CLUSTA」，在各地都有不同的文化发展以及适合在地生活的人类居住。

在遥远的十二号行星阿莫伊上，存在着一个扭曲的社会。这个社会由巨型电脑朱庇特所掌控。为了净化基因，人类被放逐了，一般的生育方式被彻底抛弃，朱庇特通过直接操控基因的方式，制造出了一大群更加完美的生物体，他们美丽，强壮，聪明，但冷酷无情、野心勃勃。这群所谓的“超人类”成为了普 通人类的统治者，他们通过发色来区分等级，其中，黑发和金发，分别处于等级的最底层和最高层。