盲剑客座头市（胜新太郎 饰）独行天下，扶弱济贫，但他渐渐厌倦了血雨腥风的生活，决心返回故乡莲花泽隐居。然而宁静的故乡已被暴徒政吾郎（米仓齐加年 饰）霸占，村民饱受欺侮，苦不堪言。政吾郎得知阿市归来，遂高价聘请流浪武士佐佐大作（三船敏郎 饰）充当保镖，以伺机除掉阿市。小小村庄，二人不免狭路相逢，不过几次决斗皆因各种原因而推迟。所谓英雄惜英雄，这不断推迟的对决让两人的斗志逐渐燃烧起来……

黑田藩藩主齐隆侯将宠爱的妃子生的女儿滨千代公主假扮男孩，秘密继承储君之位。菩提寺住持慈善和黑锹忍者得知此事，写作秘函送往江户。拜一刀（若山富三郎 饰）受黑田藩所托，追赶主持抢夺秘函。途中拜一刀遭遇黑田藩忍者不知火（安田道代 饰），从其口中察觉事件背后的秘密。秘函抢夺成 功，柳生烈堂（大木实 饰）派出大量刺客截杀，但全部死在拜一刀手下。黑田藩重臣肋天将监斥责齐隆侯用女儿继任储君，意欲杀其谋反。受不知火所托的拜一刀由此卷入这场继嗣风波之中……

尾张藩别式女（护卫殿下安全的随身侍女）小雪（东三千 饰）被藩士孤冢元记（岸田森 饰）用妖刀打败，愤而脱藩。尾张藩派出多名刺客追杀，皆死于小雪手下。其中一名被杀刺客的妻子为报夫仇，雇用拜一刀（若山富三郎 饰）刺杀小雪。寻访途中，拜一刀和儿子大五郎（富川晶宏 饰）走散。柳生家族弃将军兵卫（林与一 饰）一度被大五郎错认为父，大五郎锐利的目光引起军兵卫注意，一路跟踪。好战心切的军兵卫挑战拜一刀，却无奈落败。拜一刀追踪小雪来至温泉，尾张刺客孤冢元记亦随后赶到，在拜一刀面前，昔日两个仇家剑拔弩张…

在黑暗时代,妖术师果心居士唆使松永弹正夺取天下,一对青梅竹马的忍者恋人城太郎(真田广之 饰演)与篝火(渡边典子 饰演)成为了最无辜的牺牲品!为了拯救被绑架的爱人篝火,城太郎与果心居士及其部下,展开忍术与邪术的决战..........