全52話と全25話で2度のTVアニメ化を果たした漫画『ハヤテのごとく！』の劇場アニメ化が決まった。アニメーション制作は第1期のSynergySPでもなく、第2期のJ.C.STAFFではなく、マングローブ。　　監督は劇場アニメ『ハヤテのごとく！』が初監督作品となる小森秀人さん。脚本は『灼眼のシャナ』シリーズや『仮面ライダー電王』の小林靖子さん。

　　故事讲述西元2060年的地球，人口爆炸，造成严重的社会问题，为了抑制入人口，凡是生育超过一个小孩的人都必须处死。岂料有一个超级花花公子竟然让100个女人怀孕，导致生下100个具有相同好色基因（DNA）的小孩散布在世界各地。为了解决这个可怕的问题，未来政府派遣一位少女特使－－加林，穿越时空来到90 年代，试图找出这个16岁的高中嫌犯：超级花花公子……

2000年。在长野山中的九郎岳，正在进行某座神秘遗迹的挖掘工作，遗迹内的一具棺木中藏有一个佩戴石化腰带的古尸。孰不知当调查团将棺木开启时，亦因此唤醒了它的死敌“古朗基”。调查团立即遭到未确认生命体的袭击而全数死亡。而在为了查出调查团被杀案件的线索，正在遗迹现场调查中的长野县刑警一条薰面前，有一名青年突然擅自闯入。这名被一条拦下的青年，他自称为冒险家五代雄介。终于复活的未确认生命体在长野近郊出现，并开始袭击人们，甚至一路冲进警局。在场的雄介感应到从遗迹出土，由警方保管的腰带状遗物所传来的战士形象，在腰带的感召与冒险家的直觉下将之装着于腰部。雄介的身体也随之覆上一层强化肌肉，变身后的雄介与袭击警局的未确认生命体经过一场苦战后终于将其击倒。随着未确认生命体不断出现于大城市东京，五代雄介下定决心为了让周遭的人们免于恐惧，守护他们的笑容而战……新一代假面骑士“空我”诞生！

　　在爱迪·奥特曼离开地球后的25年，人类终于渡过了名为“怪兽频出期”的恶梦，时间飞逝直到当一次怪兽袭来时，地球的全新防卫队CREW GUYS JAPAN队只剩一人幸存。　　在此同时，被奥特之父派遣来地球的宇宙警卫队新人梦比优斯·奥特曼来到了地球，并化身成“日比野未来”，与其他新加入的GUYS队员们，一同展开与怪兽决斗的战役。　　并透过未来的角度，描述了历代超人战士保卫着地球的过程，GUYS队员们的羁绊及梦比优斯自我成长的故事。

　　二十世纪初的日本太正时代，自明治维新以来的文明开化已进行了五十余年。　　随着西洋文化和日本传统文化的交汇融合，帝都·东京逐渐成为现代化建筑鳞次栉比，蒸汽铁道、地下铁道纵横交错，马车、人力车、蒸汽车川流不息的繁华都市。然而，这也是一座有着怪物和咒术等非现实存在的魔幻都市。　　为了对抗从地底出现的强大魔物“降魔”，陆军成立了由将校中的灵能者组成的特殊部队——对降魔部队，成员即“二刀二剑”的4位继承者：米田一基，持有 “神刀·灭却”；山崎真之介，持有“光刀·无形”；藤枝菖蒲，持有“神剑·白羽鸟”；真宫寺一马，持有“灵剑·荒鹰”。四人仅凭自己的血肉之躯和手中的神剑与魔物作战，史称“降魔战争”。激战的结果，陷入绝境的对降魔部队被迫使出最后的手段——利用“魔神器”发动“破邪之血”。魔神器即日本上古时代流传下来的三种祭器：剑、珠、玉，可以成为魔力的增幅器。继承真宫寺家“破邪之血”的一马，以自己的生命为代价用魔神器将降魔们封印，而山崎真之介也在此战中失踪……　　太正十一年，以妖僧天海为首的邪恶组织“黑之巢会”蠢蠢欲动。仇视近代文明的天海为了复辟德川幕府的统治，率领手下的死天王葵叉丹、弥勒、修罗、罗刹，操纵着利用古代咒法生出的魔物——魔操机兵在帝都展开了破坏活动。为了对抗这新的威胁、守护帝都和民众，在花小路伯爵的大力支持下，新的政府直属对降魔组织——帝国华击团（简称“帝击”）·花组成立了。在米田一基、藤枝菖蒲的领导下，花组集结了6名具备高灵力的少女：真宫寺一马的女儿、灵剑·荒鹰的继承者真宫寺樱；神崎财阀总帅忠义的孙女、精通神崎风尘流长刀术的神崎堇；俄国革命的勇士、曾有“食火鸟”之称的玛丽亚·橘；自幼就因超常的灵力被与世隔绝、年仅10岁的法国贵族千金爱丽丝；在辛亥革命的战乱中失去亲人、精通机械的中国少女李红兰；以及桐岛流空手的正统传人、身高近 2米的桐岛神奈。同时，基于山崎真之介留下的设计，由神崎重工完成了对降魔用灵子甲胄“光武”。以银座大帝国剧场为基地、平日以歌剧团面目出现来掩人耳目的花组，在魔物出现时就会变为守护帝都的战士，驾驶光武与敌人作战。　　太正十二年春，苦于战力及协作性不足的花组来了一位新队长——海军少尉大神一郎，《樱花大战》的故事也就从这里开始了……

　　皿屋敷中学的不良少年浦饭幽助终日无所事事，或与青梅竹马雪村萤子吵架拌嘴，或拿死对头桑原和真出气。某日，逃课玩耍的幽助从车轮下救起一位小姑娘，自己则被汽车撞死。他的举动出乎灵界的预料，因此得到一个复活的机会。经过一次次的考验，幽助最终在萤子和桑原的帮助下重返人间。　　在此之后，他成为一名灵界侦探，专门负责各种奇异的犯罪事件。在一次任务中，幽助又结识了化名南野秀一的妖狐藏马和盗贼飞影。所谓不打不相识，幽助、桑原、藏马、飞影成为共同进退的搭档。他们一同参加了云集强大妖怪的暗黑武术大会，与恐怖的户愚吕兄弟一决胜负。以此为肇始，此后他们与魔界的纠葛越来越深，战斗愈加激烈……

　　深夜，列车因暴雨引发泥石流而被停在半路。一节车厢中的八名乘客，全部陷入了不明原因的昏迷当中。调查结果则更让人心惊，其中一位乘客已经成为了冰冷的尸体……侦查中乘警发现了针管，其他几位乘客各执一词，使得案件更加扑朔迷离。在调查陷入僵局之时，一桩十年前的校园暴力案件浮出水面， 当年的真相被人掩盖，真正的犯人又会是谁？

　　乡村小医生杨逸机缘巧合之中卷入乔兰未婚夫大志暴毙的离奇案件。神秘的歌声，鲛人泣珠成泪的传说，怪异的玉梳将杨逸一步步引向神秘的河底，在案情逐渐明朗之际却屡屡遭到神秘力量的阻拦与破坏。杨逸无意之间得到神仙姐姐的指点，逐步解开谜团，拯救神仙姐姐，成为一代超级小郎中。

　　这个城市里游荡着一个连环杀手,专挑特定女性下手。与此同时，公司职员孙小宝觉得最近有个黑衣人跟踪自己,而且明显地感觉到自己最近状态不佳,经常大脑一片空白,在自己不知情的情况下做出一些莫名其妙地事。 黑衣人如影随行,其后孙小宝遭遇了几次“失忆”,孙小宝清醒后发现自己均置于危险境地。孙小宝隐隐觉得自己被人暗算了,于是孙小宝报了警。 孙小宝生活在不断地失忆与恐惧中，警察也向孙小宝反馈了调查结果:结合目击者与监控录像,警方认为没有证据显示有人要对孙小宝不利,跟踪者也不存在。警方认为孙小宝可能是因为压力太大而出现了幻觉,建议孙小宝去看医生。

第四次忍界大战结束的两年后，此时此刻的漩涡鸣人（竹内顺子 配音）早已成为盖世英雄一般的人物，无论他走到哪里都受到女孩子和小朋友的喜爱与追捧，他似乎也有其享受这样喧嚣欢闹的氛围。与之相对，壁花小姐日向雏田（水树奈奈 配音）则始终站在角落里，默默注视着这个她喜欢了多年的男孩子。雏田亲手为鸣人织了围巾，怎奈无法鼓足勇气交给对方，喜欢的话语更难以说出口。某个夜晚，雏田的妹妹花火（浅井清己 配音）遭到不明身份之人劫持，带火的陨石则落在附近的山坡之上。为了救回花火，阻止地球毁灭，鸣人、雏田、小樱（中村千绘 配音）、鹿丸（森久保祥太郎 配音）和佐井奉命前去调查舍人（福山润 配音）的真身。在此过程中，鸣人不小心知晓了雏田的心意……